Koordinatar: 67°8′3.2244″N 13°47′6.3420″E Fleinværfjorden er ein fjord i Gildeskål kommune i Nordland. Fjorden ligg på søraustsida av Fleinvær og strekkjer seg om lag 11 km frå sørvest til nordaust. På andre sida av fjorden ligg øya Fleina, Sørarnøya og Nordarnøya.

Nord for Fleinværfjorden ligg innløpet til Saltfjorden.